La Direction de la Planification Spatiale : relancer la planification spatiale pour rendre les territoires plus cohérents et plus attractifs, à travers :

- l’élaboration et l'évaluation(ACS) des instruments de planification spatiale au niveau des territoires (Plan Directeur d’Aménagement au niveau des pôles ou zones, Schéma Directeur d’Aménagement, etc.);

- La stratégie et l'animation des politiques sectorielles;

- la promotion de l’ingénierie territoriale pour rendre les acteurs des territoires capables de faire face aux mutations spatiales.

La Direction du Développement Territorial: promouvoir la valorisation des potentialités régionales et locales pour rendre les territoires plus compétitifs, à travers:

- l’impulsion du Marché des Territoires pour l’émergence des projets locaux et régionaux ;

- la contractualisation Etat-Territoires et Secteur Privé pour la réalisation des projets locaux et régionaux ;

- L’impulsion des projets d’aménagement d’espaces de croissance (zones industrielles, zones d’aménagement concerté, etc.) nécessaires à la construction des pôles régionaux de développement prévus par l’agenda spatial ;

Le Pôle Observatoire des territoires: soutenir la planification et l’économie des territoires, à travers :

- la veille et la prospective territoriale ;

- le développement des outils d’aide à la décision à divers niveaux et échelles (travaux cartographiques) ;

- la réalisation des études / analyses des dynamiques et disparités spatiales.

La Direction de l'Administration et des Finances: asseoir l’action de l’ANAT sur une gouvernance saine et durable, à travers :

- la gestion financière et comptable de l’Agence ;

- la gestion des ressources humaines de l’Agence ;

- la gestion administrative de l’Agence.

L'Unité de Stratégie et Développement : développer des mécanismes institutionnels, réglementaires et financiers innovants pour impulser l’aménagement du territoire, à travers :

- le développement de la coopération nationale et internationale pour des programmes innovants ;

- l’animation des plates-formes intersectorielles d’aménagement (CSAT et CNAT);

- le suivi-évaluation des actions de l’ANAT.

Le Guichet d’Appui aux Territoires (GATE) au niveau de chacun des six (06) pôles régionaux de développement pour assurer les missions opérationnelles de l’agence.

Il constitue:

- un noyau d’expertise au niveau régional qui encadre en matière d’aménagement du territoire, les différents territoires / acteurs du pôle régional ;

- un point d’appui parfaitement articulé au Directions Départementales du Cadre de Vie et du Développement Durable ;

- un pôle d’assistance-conseils aux côtés des Préfets et au service des collectivités locales.